【摘 要】
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板栗是雌雄同株异花植物,雌雄花比例可达1∶2 400～1∶4 000,大量雄花消耗了过多的树体营养,使营养物质在分配和输导上不利于雌花的形成与发育,同时还能造成雌花发育不良与落花落果,进而导致板栗的低产低收,通过对板栗花芽性别分化的调控来增加雌花数,降低雄花数是解决板栗低产问题的关键方法,而对板栗花芽发育和性别分化的研究是调控花芽性别分化的基础.本研究以北京怀柔区盛果期燕山红栗雌花分化期的完全混合
【机 构】
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农业应用新技术北京市重点实验室/北京农学院植物科学技术学院 北京农学院生物科学与工程学院 北京10
【出 处】
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第六届全国果树分子生物学学术研讨会
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板栗是雌雄同株异花植物,雌雄花比例可达1∶2 400～1∶4 000,大量雄花消耗了过多的树体营养,使营养物质在分配和输导上不利于雌花的形成与发育,同时还能造成雌花发育不良与落花落果,进而导致板栗的低产低收,通过对板栗花芽性别分化的调控来增加雌花数,降低雄花数是解决板栗低产问题的关键方法,而对板栗花芽发育和性别分化的研究是调控花芽性别分化的基础.本研究以北京怀柔区盛果期燕山红栗雌花分化期的完全混合芽与不完全混合芽为试材,应用高通量测序技术进行转录组测序,以板栗基因组草图数据为参考,寻找未被现有基因组注释的转录区,预测和发掘板栗的新转录本和新基因；查找基因区潜在的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点；预测新可变剪接事件(Alternative Splicing Events),并对基因组原有基因进行基因结构优化分析.对分析所得的所有转录本和基因进行表达水平定量,并进行基因差异表达分析,获得不同花芽间的差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs),并对DEGs作表达模式聚类分析.同时,将所有DEGs与GO,KEGG,COG,Swiss-Prot,NR等生物信息数据库进行序列比对,获得DEGs的注释信息.最终,共发掘得到板栗新基因1,385个,获得SNP位点总数155,885个,预测新可变剪接事件共24,598个,基因结构优化分析共得结构优化基因9,116个,上述结果补充和完善了现有板栗基因组的注释信息.分析共得基因36.349个,共筛选完全混合芽和不完全混合芽间的差异表达基因642个,其中上调基因338个,下调基因304个,有注释信息的DEGs 621个,其中GO注释532个,KEGG注释86个,COG注释250个,Swiss-Prot注释492个,NR注释621个.通过基因功能注释发现完全混合芽和不完全混合芽富集差异基因的代谢途径主要为：碳代谢途径、能量代谢途径、萜类和酮类化合物的代谢途径、氨基酸代谢途径、脂质代谢等.研究结果有助于找出可能决定板栗雌雄分化差异相关的潜在调控网子,为进一步揭示板栗雌雄分化的分子机制奠定基础.
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