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We sequenced the genome of Sonneratia alba,a highly salt tolerant mangrove tree using next generation sequencing technology.
The genome of a mangrove tree Sonneratia alba
【摘 要】
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We sequenced the genome of Sonneratia alba,a highly salt tolerant mangrove tree using next generation sequencing technology.
【作 者】
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【机 构】
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Guangdong Key Lab of Plant Resources Key Laboratory of Biodiversity Dynamics and Conservation of Gua
【出 处】
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第六届全国红树林学术研讨会
【发表日期】
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2013年11期
其他文献
红树林是生长在热带、亚热带海岸潮间带特有的木本植物。作为世界上初级生产力最高的海洋生态系之一，红树林群落对海岸生态平衡起着重要的作用。近年来，由于人口的快速增长、城市扩张和不适当的海滩经济开发导致红树林资源锐减，各级政府已开始重视红树林湿地的生态恢复工程。
2012年7月至10月，在北部湾沿海由广西防城港市至海南环岛的红树林区设置了12个采样点采集红树林蟹类标本并进行了鉴定.共采集到蟹类37种，隶属于12科22属，其中，沙蟹总科种类最多，为7属19种，占所有种类的51.4％；其次为方蟹总科，共10属12种，占所有种类的35.1％；梭子蟹科与毛刺蟹科各2种，玉蟹科与和尚蟹科各1种.
为了解红树蚬在广西主要红树林区的资源状况和分布特点，在广西廉州湾和珍珠湾红树林设置5条断面25个取样站进行了采样调查，珍珠湾样地位于广西防城港市江山乡石角村北仑河口国家级自然保护区，共设置3条断面9个取样站。
为探讨泉州湾洛阳河口桐花树和秋茄两种红树林生境的大型底栖动物群落是否存在明显差异,2011年4月至2012年1月对两种红树林生境的大型底栖动物进行了季度定量调查,从而为泉州湾潮间带大型底栖动物多样性研究、洛阳红树林自然保护区资源管理和生态恢复种植红树林选择提供基础资料。
红树林湿地底栖动物根据其通过筛网的大小，可以分为大型、小型和微型底栖动物。根据查阅到的有关中国红树林湿地底栖动物的文献分析，发现中国红树林湿地底栖动物研究存在如下问题：(1)国内大型底栖动物研究较多，小型底栖动物研究较少，微型底栖动物未见报道。
红树植物是研究植物在自然环境胁迫下遗传分化和适应性进化的良好材料。印度-西太平洋地区(IWP)是红树植物分布种类最丰富的区域，全世界80％的红树物种在此生存。
会议
红树植物适应于高盐缺氧的海岸潮间带环境，是研究植物适应极端环境的优良系统。卤蕨属是红树植物中唯一的蕨类植物属，在印度-西太平洋地区包括两个种：卤蕨(Acrostichumaureum)和尖叶卤蕨(Acrostichumspeciosum)。
会议
第四纪冰川导致的全球气候变化对很多动植物的群体历史具有巨大的影响。对于红树植物来说，除了气候变化的影响外，海平面的不断升降也是影响群体分布以及进化历史的一个重要因素。然而，之前的研究很少从基因组的层面上去研究这一时期气候-地质变化对红树植物群体遗传模式的影响。
啮齿动物在陆地森林和草原生态系统的植被更新过程中起着重要的作用，但在湿地生态系统特别是滨海湿地中的生态作用往往被忽视。本研究基于外来入侵植物互花米草在红树林林缘和光滩前缘两种生境中被啮齿动物啃食的不同状况，通过分析测定来自两种生境的互花米草的成分，在野外开展移植及围网控制实验，以及捕捉啮齿动物和室内饲喂实验，来验证啮齿动物对互花米草的选择性取食及其生态效应。
红树植物对高盐低氧的海岸潮间带环境有很好的适应能力，而且相对于其陆生近缘种具有独特的生理生态特征。探讨有关红树植物对海岸潮间带环境高度适应的遗传机制具有重要的科学意义。