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江苏面积大于50 km2的12个湖泊的水质恶化、面积减少、富营养化、湖泊生态系统退化与湖泊受总磷、总氮的污染和围湖造田等有关。经济快速发展，第二产业结构偏重，排放污染的总量超过湖泊承载力，湖泊底泥释放N、P及入湖河流携带污染物为造成湖泊环境问题的根本原因。建议调整产业结构，执行严格的排放标准，围绕重点区域、重点行业、重点企业和重点污染源治理，由控制COD为主转为控制COD和氮、磷并重，引水调控水质，建立湖泊资源数据库和生态系统信息网络，开展湖泊污染物来源分析和富营养化机理研究，开展跨界区域统筹对湖泊综合治理。