【摘 要】
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本研究采用RT-PCR及RACE技术从三疣梭子蟹鳃组织获得了总长度为3833 bp的Na+/K+-ATPaseα-亚基cDNA序列.该基因序列的开放阅读框3120 bp,推测编码1039个氨基酸,预测蛋白分子量115.57 kDa,等电点5.21.推测有8个跨膜结构域、一个ATP连接位点和磷酸化作用位点.利用Neighbor-joining法构建系统进化树分析结果表明,该基因氨基酸序列与与无脊椎动
【机 构】
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农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所, 青岛 266071;大连海洋大学,大连 116023
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本研究采用RT-PCR及RACE技术从三疣梭子蟹鳃组织获得了总长度为3833 bp的Na+/K+-ATPaseα-亚基cDNA序列.该基因序列的开放阅读框3120 bp,推测编码1039个氨基酸,预测蛋白分子量115.57 kDa,等电点5.21.推测有8个跨膜结构域、一个ATP连接位点和磷酸化作用位点.利用Neighbor-joining法构建系统进化树分析结果表明,该基因氨基酸序列与与无脊椎动物的甲壳动物聚为一支(同源性为86％-93％).荧光定量RT-PCR研究结果表明,Na+/K+-ATPase α-亚基基因在血淋巴、鳃、肝胰腺和肌肉中均有分布.低盐胁迫后,肝胰腺和鳃Na+/K+-ATPase α-亚基基因表达具有显著的时间差异性.说明Na+/K+-ATPase α-亚基基因可能参与了三疣梭子蟹对低盐环境的适应反应.
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由于连锁不平衡(Linkage disequilibrium,LD)在定位重要经济性状的功能基因上的实用性,最近已经受到巨大的关注.关联分析的可行性和高效性依赖于LD水平,而LD水平决定关联分析中使用群体的标记数量和密度以及实验设计.在本研究中,我们首次调查了太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)野生和选育群体的LD水平.在全基因组范围内采用53个微卫星,分别分析了88个野生个体和96个
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