【摘 要】
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实验表明,蝎活性肽BmK AGP-SYPU2 C末端55,56位氨基酸残基对其镇痛活性具有显著的影响.为了进一步研究蝎活性肽结构与功能关系,本文利用生物信息学的方法,采用modeller9v7程序及pymol软件构建BmK AGP-SYPU2及其突变体的结构,采用Amber程序对构建的结构进行结构优化与分子动力学分析,研究Bmk AGP-SYPU2及其两种突变体Mut65和Mut6566的结构变化
【机 构】
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沈阳药科大学生命科学与生物制药学院,沈阳110016
【出 处】
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第四届泛环渤海生物化学与分子生物学会2013年学术交流会
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实验表明,蝎活性肽BmK AGP-SYPU2 C末端55,56位氨基酸残基对其镇痛活性具有显著的影响.为了进一步研究蝎活性肽结构与功能关系,本文利用生物信息学的方法,采用modeller9v7程序及pymol软件构建BmK AGP-SYPU2及其突变体的结构,采用Amber程序对构建的结构进行结构优化与分子动力学分析,研究Bmk AGP-SYPU2及其两种突变体Mut65和Mut6566的结构变化,从而揭示了55,56位氨基酸残基通过改变活性肽末端的构象从而影响其镇痛活性.
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