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黄光激光器在医学、生物学研究方面有着重要的应用。首先，黄光激光波长处于很多荧光蛋白的激发峰值附近，已经变成了共聚焦显微镜和流式细胞仪的一个标准部件。其次，黄光激光器具有对血红蛋白吸收率高，能够更好地穿透核硬化晶体，热能在视网膜神经感受器中传导较少，病人较少不适感，安全性高等优点。这类激光在眼科学方面有着很多重要的应用。