病原体基因组测序与分析对于了解病原体致病机理、认识病原体进化规律,确定药物新的靶点和进行疫苗的研制都具有非常重要的作用。随着基因组测序技术的发展,大量细菌全基因组序列测定已完成并在网上公布。我们从美国国家生物技术信息中心(NCBI)网站检索、分析了炭疽芽孢杆菌(Bacillus anthracis)、肉毒杆菌(Clostridium botulinum)、鼠疫耶尔森氏菌(Yersinia pestis)、土拉热弗朗西斯菌(Francisella tularensis)等四种主要生物威胁细菌类病原体已完成测序菌株的分离来源、毒力特点等情况、介绍了主要完成机构：美国能源部联合基因组研究所(Joint Genome Institute)、美国克莱格·凡特研究所(Joint Genome Institute)、美国劳伦斯·利弗莫尔国家实验室(Lawrence Livermore National Laboratory,LLNL)、美国洛斯阿拉莫斯国家实验室(Los Alamos National Laboratory)、瑞典防御研究局(The Swedish Defence Research Agency)、英国桑格研究所(The Wellcome Trust Sanger Institute)的发展历程和研究重点等,通过分析我们认为在生物防御医学科研,特别是针对烈性病原体的研究中,国家级研究机构应当发挥主要作用；在病原体菌株保藏与管理中,在保证生物安全的前提下,要加强资源的共享,并加强信息的公开；要重视我国少见的一些生物威胁病原体的研究,同时基因组测序菌株的选择要有代表性。