丹顶鹤(Red-crowned crane)是中国国家一级保护动物,在世界自然保护联盟(IUCN)的红皮书中是濒危物种,在濒危野生动植物种国际贸易公约(CITES)中列入附录一.尽管目前丹顶鹤的状况有所改善,但是,仍存在一系列的问题,制约着丹顶鹤种群的进一步发展.圈养条件下丹顶鹤种群的小规模、再分配,以及非自然选择的危险,可能导致遗传变异的损失以及诸如亲子关系混乱、近亲繁殖等问题.建立丹顶鹤谱系,并应用遗传标记对丹顶鹤进行亲子鉴定,遗传评估和监测已成为丹顶鹤移地保护工程的当务之急.本研究采用二代测序技术,对丹顶鹤进行全基因组Survey,对所得数据进行微卫星位点的筛选.随机选择3-6碱基重复的序列设计了445对引物,建成了丹顶鹤微卫星数据库.前期挑选了59对合成荧光引物.现已筛选得到了多态性含量较高,重复性好的位点三十余个.2013 年我们采用该套标记对部分动物园圈养丹顶鹤进行了亲子鉴定：重庆动物园(7 只)、上海动物园(6 只)、成都动物园(9 只).由于采集到的样品中有部分没有登记性别,为了保证结果的准确性,我们同时对所有样品开展了性别鉴定工作.每个样品每对微卫星引物均做了3 次以上重复性验证,鉴定结果非常准确,可以纠正现有谱系中存在的错误.