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本研究以长江三角洲某典型污染区PCBs复合污染农田土壤为对象，采用田间小区试验研究豆科植物紫花苜蓿和禾本科植物黑麦草、高羊茅对PCBs复合污染土壤的修复效率，并采用基于高通量的焦磷酸测序技术的土壤宏基因组学方法对不同修复植物根际土壤中复杂的微生物群落结构多样性进行了比较分析，研究结果表明豆科植物紫花苜蓿因具有生物量大、根部吸收富集PCBs能力强等优点，其单作时对土壤中PCBs的提取修复效率最高；紫花苜蓿与禾本科植物黑麦草、高羊茅间作后，可分别提高黑麦草、高羊茅单作对土壤PCBs的植物提取修复效率；紫花苜蓿与禾本科植物间作后可显著提高土壤中微生物群落的丰富度和多样性，紫花苜蓿根际土壤中的特定微生物类群在PCBs的污染土壤的植物协同修复过程中起着关键作用。