SRF等胃癌转移相关基因CpG岛甲基化标志物筛选和验证

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目的在胃癌DNA甲基化组学检测基础上筛选胃癌转移相关的甲基化标志物。方法和设计从已有的胃癌转移相关甲基化组数据中选择35个基因CpG岛,分别建立DHPLC甲基化测定方法;研究对象:筛选队列-1由51对pTnN0M0-胃癌和51对pTnNnM1-胃癌及其切缘组织样品构成;筛选队列-2由97对pT1-4N1-3M0-胃癌样品构成;中、日、韩三国独立验证队列由pT1-4N0-3M0-胃癌样品(N=125、55和123)构成;对照样品31例正常/胃炎活检组织。利用SPSS16.0软件进行统计学分析。结果经筛选队列-1分析,发现35个受检基因中只有BMP3、GFRA1、HOXD10、KCNH1、p16和SRF的甲基化在胃癌和切缘组织中存在差异(P<0.05),其中GFRA1和SRF的甲基化与胃癌的转移显著相关(P<0.05)。对已知的肿瘤转移促进基因SRF进一步研究发现,其甲基化位点分布位于5’UTR区;人胃黏膜组织中甲基化的SRF含量与其mRNA水平呈负相关;SRF甲基化阳性率与胃癌发生相关,在胃癌、切缘、正常/胃炎组织中分别为29.0%、19.6%和13.0%(P=0.029);免疫组化分析发现,SRF蛋白表达在肿瘤间质细胞和部分平滑肌细胞中。在筛选队列-1的切缘组织中,SRF甲基化与胃癌的转移和浸润深度负相关(P=0.005和0.025);在筛选队列-2中亦发现切缘组织SRF甲基化与浸润深度呈负相关(P=0.003)。对这两个队列中108例无远处转移的远端胃癌进行Kaplan-Meier生存分析见,SRF甲基化阳性患者的术后总生存期明显的长于阴性患者(3年生存率,79.6%vs.62.4%;P=0.018);在中、日、韩三国没有远处转移的远端胃癌独立验证队列中,SRF甲基化阳性患者和阴性患者的三年生存率分别是:73.2%和51.2%(中国,N=81,P=0.067);60.0%和45.2%(日本,N=46,P=0.066);91.9%比72.1%(韩国,N=123,P=0.020)。Cox多因素分析表明,在中国队列和韩国队列中,SRF甲基化是判断胃癌预后的独立因素,显著降低胃癌患者的死亡风险(HR=0.488和0.348;95%CI分别为0.242-0.985和0.122-0.997)。结论 BMP3、GFRA1、HOXD10、KCNH1、p16和SRF在胃癌组织中高甲基化;SRF甲基化与胃癌转移呈负相关,可作为判断远端胃癌预后的标志物。
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