Network and machine learning algorithms in Bioinformatics research

来源 :第二届中国计算机学会生物信息学会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:FreeDom_BBQ
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  In this talk,the following effective computational models developed by Chen Group for the Bioinformatics research will be introduced: 1)PBMDA(PLOS Computational Biology,2017,13(3): e1005455,cited 11 times): Path-Based MiRNA-Disease Association(PBMDA)prediction model was proposed by constructing a heterogeneous graph consisting of three interlinked sub-graphs and further adopting depth-first search algorithm to infer potential miRNA-disease associations.
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依托于云南磷化集团晋宁磷矿6#坑深部缓倾斜中厚磷矿充填法地下采矿工程,采用有限元数值模拟的方法,通过不充填和折减充填体强度研究地下开采下充填体强度对地下开采下围岩和边坡的应力,位移以及塑性区范围的影响进行分析和研究,结果表明提升充填体的强度可有效降低边坡内部位移和应力的变化,可有效改善围岩应力状态,并限制了围岩破坏及裂隙的发展,减少了地表下沉范围和下沉量,结果可拱充填法地下采矿进行参考。
本文基于能量变分法及混凝土徐变理论,建立了两跨逐跨施工连续梁考虑剪力滞效应的混凝土徐变次内力计算公式.以两跨逐跨施工连续箱梁桥为例,研究了连续梁体系转换后由于前后梁段由于加载龄期的差异所引起的徐变次内力对其剪力滞效应影响,并和ANSYS 有限元数值解进行了对比分析.结果表明:本文理论解与数值解符合良好,对于存在施工过程体系转化的逐跨施工连续梁桥,徐变次内力增加了梁体在负弯矩区的弯矩、减小了梁体正弯
针对目前铁尾矿利用率低的现状,对利用铁尾矿制备混凝土的工艺进行了研究。针对目前建筑工程中常见路缘石的一些局限性,对传统路缘石的块型结构进行了优化设计,对其制备成型工艺进行了试验研究。最终以铁尾矿为主要原料,设计并制备了整体性能优良、施工简单的新型路缘石。
细胞是生物体最基本的结构和功能单元,蕴含了大自然千万年进化所沉淀的智能,其中DNA 分子具有存储容量大、存储密度高、自组装等特点,是信息处理值得探索的理想载体之一。该报告将介绍生物计算的研究背景、理论和实验的研究进展,及其在系统生物学中的应用,如靶向载药、测序、高分辨率荧光成像等。
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本研究通过理论设计和试验验证提供了一种新型地砖,其目的除了充分回收利用废弃建筑垃圾和铁尾矿,更定位于可以夜晚指示路线并且可以自由组合的功能,其具体功能体现为:按应急疏散路线自由粘贴夜光带,从而指示路径的方向和位置。如果使用过程中指示路线发生改变,可以任意重新粘贴夜光带。具有强度较高,指示标志连贯明确,路径可以自由组合,耐久性、防滑性好和造价低廉的优点。
基因序列的比对、挖掘和功能分析是计算生物学中最基础的科学问题。本次报告围绕这三个方面介绍报告人近年来的部分成果。在序列比对方面,介绍一种基于后缀树和并行加速的多序列比对和进化树构建算法;在基因挖掘方面,介绍本人近年来在microRNA 识别方面的部分工作,主要贡献在于探索高质量反例数据和设计全新的集成分类器;在基因功能分析方面,分别介绍基因-疾病关联分析和基因-作物产量关联分析等工作。
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We establish a bioinformatics platform system(http://lilab.sysu.edu.cn/Tools/)for omics data analysis at Sun Yat-sen University,which currently offers applications of sequence similarity search(SSS),g
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生物序列到其结构和功能的映射关系与语言中词到词义的映射关系类似。在语言学中,由字词通过语法组成有意义的句子。在生物学中,氨基酸或核酸组成具有特定结构和功能的生物大分子序列。
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High-throughput technologies produce large amounts of data,such as levels of gene expression or drug responses.Identification of gene-drug interaction patterns among the expressing data is important t
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