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黏菌是一类既具有动物特性又具有真菌特性的特殊生物类群。基于形态学特征的黏菌系统发育研究已取得了很大的进展,但仍存在着许多没有解决的难点。分子系统学是近年来的研究热点,结合分子数据以期建立更趋自然关系的分类系统。本文对黏菌纲部分代表种的12S rDNA和18S rDNA基因片段进行了扩增和测序,并结合GenBank中BLAST搜索到的黏菌纲的相关序列,以原生动物和真菌为外群,通过MEGA4.0分析,对黏菌纲中无丝菌目(Liceales)、团毛菌目(Trichiales)、绒泡菌目(Physarales)和发网菌目(Stemonitales)的分子系统关系进行了探讨。研究结果表明:(1)无丝菌目的大粉瘤菌(Lycogalaflavofuscum)与团毛菌目的棒形半网菌(Hemitrichia clavata)亲缘关系较近,且大粉瘤菌与绒泡菌目的粉红双皮菌(Diderma testaceum)亲缘关系较近,而与绒泡菌目的灰绒泡菌(Physarum cinereum)亲缘关系次之。由此推断,无丝菌目与绒泡菌目、团毛菌目亲缘关系较近,而与发网菌目亲缘关系较远。(2)发网菌目的香蒲拟发网菌(Stemonitopsis typhina)与绒泡菌目的粉红双皮菌(Diderma testaceum)亲缘关系较近;绒泡菌目的黑柄钙皮菌(Didymium nigripes)和团毛菌目的暗红变毛菌(Metatrichia vesparium)亲缘关系较近;发网菌目的美发网菌(Stemonitis splendens)与团毛菌目的Trichia sericea亲缘关系较近,而与绒泡菌目的灰绒泡菌(Physarum cinereum)亲缘关系次之。由此推断,绒泡菌目与团毛菌目亲缘关系较近,而发网菌目介于二者之间。另外,本研究首次对香蒲拟发网菌12S rDNA、蓝灰团网菌和美发网菌18SrDNA进行了PCR扩增以及序列的测定,为黏菌这一特殊生物系统演化的分析提供了基础数据。