东沙岛面积虽小,但沿岸的海草床是台湾面积最大,也是海草丰度与多样性最高的海域.自2009年11月至2010年10月间,平均每两个月一次,调查6种优势海草的分布与栖境,并分析其环境因子之差异.结果显示,圆叶水丝草(Cymodocea rotundata)的高适应性使其能广泛分布于光度充足的小潟湖与潮间带.锯齿叶水丝草(Cymodocea serrulata)因不耐盐度剧烈变动与强光的浅水域,因此多分布于北岸较深的亚潮带.泰来草(Thalassia hemprichii)因为叶片厚,可耐曝晒与干旱,是潮间带环境中适应性最好的优势种.单脉二药草(Halodule uninervis)对高温有较佳的耐受性,在小潟湖与浅海域为优势种.水韭菜(Syringodium isoetifolium)不耐干旱与高光度,但因为叶纤细呈圆柱形,于南岸水流强劲的亚潮带为优势种.卵叶盐草(Halophila ovalis)因为具有快速匍匐生长的地下茎,常成为空旷沙底质或海草床边缘的先驱种.整体而言,东沙海域因具有多样性的栖境,使得各种具有不同生长特性与偏好之海草能共同生长于此海域,形成东沙岛海域海草多样性与分布差异.