近年来禁抗、限抗政策趋紧,在国内微生态等生物发酵制品已经成为保障"减抗替抗"顺利实施的主力产品之一。芽孢杆菌因其良好的热稳定性和促生长等优点在畜禽养殖业得到广泛应用。为评估市售主要成分为芽孢杆菌益生菌产品的安全性,以市面销售的芽孢杆菌为主要有效成分的益生菌产品为研究对象,进行芽孢杆菌分离鉴定,对分离株进行毒性及耐药性的评估。毒性评估包括在基因、蛋白和细胞水平的毒素特征研究。耐药性评估包括分离株耐药谱的调查;通过全基因组测序数据分析分离株中可移动耐药基因的携带情况及其基因环境分析。共收集用于人、动物、植物和环境的益生菌产品78种,分离鉴定得到芽孢杆菌114株,其中蜡样芽孢杆菌43株,枯草芽孢杆菌62株,芽孢杆菌属其他种细菌9株。41%(47/114)分离株具有溶血性。对于益生芽孢杆菌分离株,32%(37/114)的分离株可产生蜡样芽孢杆菌常见的肠毒素(Nhe和Hbl);94%(107/114)芽孢杆菌分离株携带编码非核糖体肽合成酶控制合成的脂肽类毒素毒力基因簇。值得注意的是,分离到4株质粒携带、产致吐毒素(cereulide)的蜡样芽孢杆菌。耐药性分析表明,分离株对四环素和红霉素耐药率较高,且耐药性表现出明显的种特异性。值得注意的是,全基因组数据分析发现几乎所有蜡样芽孢杆菌分离株均携带有部分的van基因簇基因,并且来源于人用益生菌分离株的van基因相似度显著高于其他来源的分离株。益生菌产品分离菌株不仅可以表达多种细菌毒素,而且还携带具有可移动性的耐药基因。因此,不合理、广泛应用益生菌产品,将对人、畜禽以及环境等公共健康都将构成严重威胁,亟需对益生菌菌株的筛选和使用进行安全性再评价。