由豇豆单胞锈菌(Uromyces vignae)引起的小豆锈病,是严重影响小豆产量及品质的重要病害,明确小豆抗锈病基因,深入探索小豆抗锈病的分子机理,将为抗病品种培育及利用抗病基因防治病害提供重要参考。因此,本研究在鉴定获得高抗锈病小豆资源的基础上,采用iTRAQ定量蛋白组学技术分析了小豆抗病品种响应锈菌侵染不同时期的差异表达蛋白,结果表明,接种后24 h(气孔下囊形成)、48 h(吸器形成)及120 h(花斑期)鉴定共获得154个差异表达蛋白。差异蛋白功能注释表明,接种后24 h活性氧代谢相关基因SOD、POD显著上调表达,接种后48 h和120 h抗病相关蛋白PR-2、PR-3、PR-4、PR-5及DIR22等显著上调表达。进一步的GO和KEGG富集分析发现,接种后24 h活性氧代谢及次级代谢物合成通路显著富集,接种后48 h差异蛋白主要富集于基因表答调控及类黄酮生物合成途径,接种后120 h显著富集的GO条目包括防卫反应、先天免疫反应,显著富集的代谢通路包括类黄酮生物合成、异黄酮生物合成、苯丙烷生物合成等。上述结果暗示小豆抗病品种对锈菌的抗性可能依赖于活性氧对下游防卫反应相关基因的激活效应。本研究通过比较分析病菌侵染不同阶段的差异表达蛋白,初步明确了参与小豆抗锈病关键基因及其可能的机制,对克隆抗锈病相关基因及利用抗病基因改良小豆资源的抗锈性具有重要意义。