切换导航
文档转换
企业服务
Action
Another action
Something else here
Separated link
One more separated link
vip购买
不 限
期刊论文
硕博论文
会议论文
报 纸
英文论文
全文
主题
作者
摘要
关键词
搜索
您的位置
首页
会议论文
Drude可极化蛋白质力场的发展与应用
Drude可极化蛋白质力场的发展与应用
来源 :2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qishi008
【摘 要】
:
分子力场作为许多分子动力学模拟和计算机辅助药物设计方法背后的计算模型,决定了这些理论方法的精度极限。这里,我们将介绍基于经典Drude谐振子模型的可极化分子力场的发展,尤其是蛋白质力场的发展与应用。
【作 者】
:
黄晶
【机 构】
:
浙江省结构生物学研究重点实验室,西湖大学,生命科学学院,浙江省杭州市石龙山街18号,310024;浙江西湖高等研究院,生物学研究所,浙江省杭州市石龙山街18号,310024
【出 处】
:
2019中国化学会第十五届全国计算(机)化学学术会议
【发表日期】
:
2019年3期
【关键词】
:
分子力场
可极化力场
分子动力学模拟
自由能微扰
下载到本地 , 更方便阅读
下载此文
赞助VIP
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
分子力场作为许多分子动力学模拟和计算机辅助药物设计方法背后的计算模型,决定了这些理论方法的精度极限。这里,我们将介绍基于经典Drude谐振子模型的可极化分子力场的发展,尤其是蛋白质力场的发展与应用。
其他文献
Accelerating the Computation of Free Energy Profile at ab initio Levels via a Reference-Potential Ap
Free energy calculations at an ab initio QM/MM level are a daunting challenge,due that extensive phase space sampling is always indispensable before convergence can be reached and for most cases many
会议
Free Energy Profile
QM/MM
Multistate Bennett Acceptance Ratio
Thermodynamic Pert
AIMS-结合人工智能和分子模拟技术构建的分子液体物理性质数据库系统
分子动力学模拟可以比实验测量更高效地获得凝聚态的物理性质。然而,受到分子力场和采样效率的限制,迄今为止这种方法未能成为定量地预测分子液体性质的通用方法。
会议
分子模拟
人工智能
分子液体
热力学性质
数据库
低维度碳材料体系的开发与应用
新型碳材料的设计与合成一直是物理化学和材料化学领域内的一个热点话题。我们在近期的工作中尝试从理论的角度解释和理解石墨烯材料提高染料敏化太阳电池(DSSC)光电转化效率的微观量子机制[1]。
会议
石墨烯
碳纳米管
二维T-C3N
染料敏化太阳能电池
海水淡化
“臂-爪”状loop的赖氨酸突变加速纤维二糖水解酶的催化循环
木质纤维素生物质转化后可生成生物燃料和生物化学品等,用于能源和化工等领域[1]。然而,在工业中,生物转化木质纤维素的成本仍然较高,而用酶成本是主要因素之一[2]。
会议
纤维二糖水解酶
分子模拟
自由能计算
催化循环
纳米粒子在聚合物囊泡中的组装
会议
新型HER/OER催化剂设计及催化机理研究
众所周知,当今世界正面临着严峻的能源和环境危机。开发一种绿色的可替代能源(如氢能)已成为亟待解决的重大问题。水电解制氢是人们最关注的一种制氢方案,高效催化剂是该方法实施的关键。
会议
水电解制氢
非贵金属催化剂
HER催化剂
OER催化剂
催化机制
液滴蒸发的动力学研究
会议
分子几何研究
本报告介绍我们近年关于分子几何表示的一些成果,主要有:大分子表面稳定高效的三角化方法及软件TMSmesh2,空间四面体网格生成,离子通道及膜体系的网格生成方法,以及分子表面(或分子)的稀疏化表示。
会议
分子表面
三角网格
离子通道与膜体系
稀疏表示
天然无规蛋白与结构蛋白的精准分子力场ff03CMAP研究
天然无规蛋白是一类在生理条件下没有稳定三级结构的蛋白质。这类蛋白在真核生物蛋白质组中的含量超过40%,而且天然无规蛋白与肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病以及糖尿病等复杂疾病的发生发展密切相关。
会议
精准分子力场
ff03CMAP
天然无规蛋白
结构蛋白
Quantum Fragmentation Approaches to Biomolecular Systems
会议
与本文相关的学术论文