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利用现场实测数据进行信号处理分析，得到振荡特征参数成为电力系统低频振荡研究的一种实用方法。针对Prony算法在低频振荡分析中实际应用的问题即现场实测数据的非平稳性和样本矩阵的数值计算问题进行了探讨。对非平稳信号采用离散傅立叶变换作为Prony 分析的数据预处理，对于样本矩阵数值计算问题采用了一种数学处理方法。用现场录波数据作为算例验证了方法的有效性。