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用扫描电镜观察页岩样品主要有观察自然断面方法和氩离子抛光方法.自然断面方法是直接从大块样品上用锤子敲取扫描电镜适用的小块(1cm3左右),一般取垂直层理和平行层理的新鲜断面,固定在样品台上,喷金后直接观察.氩离子抛光方法是从大块样品上取下小块后,先用机械方法对样品进行打磨处理,打磨成适合氩离子抛光用的光滑薄片(厚度1mm左右),然后再进行氩离子抛光.自然断面下，有机质识别比较困难，需要一定经验积累，识别要点有：有机质是非晶体，无固定形态；有机质硬度较低，矿物容易在上面形成铸模孔；通过能谱进行化学成分分析，C含量较高者（一般要超过30％）为有机质。