【摘 要】
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<正>目的探讨随机引物PCR(Arbitrary primer PCR,AP-PCR)结合克隆测序及生物信息学分析等方法在研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)菌株地域起源特征中的价值和意义。方
【机 构】
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南京军区南京总医院消化内科; 南京军区军事医学研究所;
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<正>目的探讨随机引物PCR(Arbitrary primer PCR,AP-PCR)结合克隆测序及生物信息学分析等方法在研究幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)菌株地域起源特征中的价值和意义。方法针对临床分离培养的Hp菌株的基因组DNA,采用一组10nt的寡核苷酸引物进行随机PCR扩增,选取相对保守的片段进行回收、克隆及测序,测序的基因序列提交Genbank数据库进行blast比对,收集blast比对得到的同源性较高不同地域来源螺杆菌的对应序列,用ClustalX软件进行排序,采用Mega4.0软件中的邻位相连法(Neighbor-joining)进行进化树分析。结果随机引物扩增及筛选克隆测序得到的基因产物为NADH脱氢酶G和H亚单位的部分
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