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芽胞杆菌存在于各类发酵食品中,能够分泌蛋白酶、淀粉酶、纤维素酶等多种酶类,促进原料降解及发酵食品风味提升。从高盐稀态发酵酱醪中筛选获得3株芽胞杆菌CS1.11,CS1.13,CS1.17,其中CS1.11淀粉酶酶活最大,为59.2 U/g干基;CS1.13蛋白酶酶活最大,为6500.2 U/g干基;CS1.17纤维素酶活最大,为3.42 U/g干基,3株菌具有促酱醪发酵能力。为阐明3株菌促酱醪发酵的机制,基于Illumina HiSeq X技术对其进行基因组分析,菌株CS1.11,CS1.13,CS1.17分别预测出4645,4161,4084个基因,经比较基因组学分析发现CS1.11编码基因明显多于CS1.13和CS1.17,表明CS1.11在基因资源上有优势;对预测基因进行COG,GO,KEGG注释,发现与氨基酸代谢、碳水化合物代谢及酶合成相关功能基因数量丰富,从基因资源上解释了3株芽胞杆菌促酱醪发酵相关酶活性高的特性;通过功能基因组学分析,3株芽胞杆菌分别在CAZy数据库注释到145,122,124个编码碳水化合物活性酶的基因,比较发现CS1.11基因数量优于其它2株,与其淀粉酶活性最高的结果一致。对筛选至高盐稀态发酵酱醪的芽胞杆菌进行基因注释及功能基因组学分析,将为芽胞杆菌在发酵食品中的利用提供依据,同时为阐明发酵风味物质的形成机理提供一条新的思路。