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以大沙河治理工程为例,分析防洪工程建设对水产种质资源保护区的影响,并提出保护对策.工程位于嬉子湖国家级水产种质资源保护区上游418m,不直接占用保护区.研究结果表明,工程建设对保护区鱼类多样性及区系组成、鱼类的繁殖与洄游阻隔、仔幼鱼庇护与生长、珍稀濒危物种以及保护区结构和功能等产生的影响较小.为最大限度减缓工程建设对保护区的间接影响,提出了具体的对策,包括施工期水生态保护措施、渔业资源补偿与修复、跟踪监测.