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目的：从分子水平上掌握西藏各地区H9亚型禽流感病毒的遗传进化情况，以及它与国内外H9亚型禽流感病毒的变异情况和流行规律之间的关系。方法：本研究汇集了2009年不同时间从西藏部分地市养殖场分离的3株禽流感H9N2亚型毒株，采用RT-PCR技术对其HA和NA基因进行扩增、克隆和测序，并对所得序列进行同源性和遗传进化分析。结论：禽流感病毒H9N2亚型西藏分离毒株与国内不同地域分离的流感病毒H9N2亚型毒株遗传进化并没有表现出一定的地域性，与地理位置相距较近的甘肃、宁夏等地方分离毒株同源性较低，而与地理位置相距较远的山东、浙江等地方分离毒株同源性较高。病毒是通过候鸟还是运输发生传播是值得研究的一个方面，明确病毒的传播途径和方式对西藏地区禽流感病的控制和预防具有重要意义。