黄牛STAT3基因启动子区SNP及生长相关性状的关联分析

来源 :四川省畜牧兽医学会2014学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:Dutch_deamer
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信号转导子和转录激活子3(STAT3)是JAK/STAT信号通路调控蛋白和胞质中潜在的转录因子,调控生长发育,但目前极少有研究报道其与肉牛生长性状的关联.贵州地方黄牛肉质优良,但生长发育慢、个体小,利用分子标记辅助选择提高其生长性能是其选种选育的研究重点.基因启动子变异通过改变RNA聚合酶和转录因子与调控序列的结合影响基因表达水平.本试验选择贵州地方优良品种务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池筛选基因启动子区SNP位点,生物信息学软件预测序列核心启动子区、CpG岛和转录因子结合位点,并探究SNP位点与8个体尺性状间的关联性.本试验在牛STAT3基因5’调控区鉴定得到7个新SNP位点,A-322G突变位点位于内切酶Sau96Ⅰ的识别序列,A-322G与体重性状有极显著关联,但与其他性状未达到显著性水平,可能因为样本数较少,需要增大样本数,提高生长相关性状测量的准确性后进行更深入研究。与AA/GG纯合型相比,AG杂合型个体的体重均值更为出色,AG杂合基因型可能作为肉牛标记辅助选择的靶点,这一结论对肉牛选种选育具有重要意义。A-322G突变可能是重要的功能突变位点,STAT3基因有望成为肉牛生长相关的候选基因,对STAT3基因SNP研究结果为进一步分析STAT3启动子功能和阐明STAT3蛋白对肉牛生长所起作用奠定基础。
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