技术创新是企业生存和发展的灵魂，医药产业属于技术密集型产业，提高技术创新能力、加速医药产业升级，已成为医药企业发展的共识。但是我国医药技术水平与国际先进水平仍然存在较大差距，技术创新仍然是未来医药产业发展的方向和重点。公司治理结构是企业所有者与经营者之间形成的对公司管理和控制的相互制衡的机制，这种机制从根本上影响技术创新资源的配置和决策。结合本文的理论和实证分析，建议医药上市公司完善股权结构，在保持适当的股权集中度的同时，吸纳机构投资者等多元的投资主体，形成多元化的股权结构；通过建立董事专业委员会解决董事会执行力不足的问题，同时发挥董事独立董事的作用并实现监事会的监督职能；通过完善股权激励制度，完善对经营者的绩效考核和股权激励机制；政府通过财政补贴、税收减免等措施增加对高新技术企业的投入，同时完善资本和金融市场，为企业的营造良好的融资环境和发展环境。