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本研究拟尝试两种不同的全基因组关联分析方法，对猪第一胎次产仔数和产活仔数的基因进行关联分析，比较不同方法所得结果，以获得一批与上述繁殖性状相关的SNP标记或候选基因。
猪总产仔数和产活仔数性状的全基因组关联研究
【摘 要】
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本研究拟尝试两种不同的全基因组关联分析方法，对猪第一胎次产仔数和产活仔数的基因进行关联分析，比较不同方法所得结果，以获得一批与上述繁殖性状相关的SNP标记或候选基因。
【机 构】
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华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，武汉，430070 Department of
【出 处】
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第十三次全国畜禽遗传标记研讨会
【发表日期】
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2012年3期
其他文献
本实验所用实验猪耳组织取自从2003年至2007年的不同世代的所有皮特兰猪。对所检测的各批次进行观察基因型频率、理论基因型频率以及Hardy-Weinberg平衡x’的计算，拟从基因检测角度来描述和展现皮特兰猪基因世代选育过程及氟烷基因变化规律，以期为今后同类育种工作提供借鉴。
为更好的了解IGFl基因的功能和调控机制，选取黑龙江省农业科学院畜牧研究所胚胎分子实验室保存7头纯野猪基因组样品，以NCBI数据库提交的家猪IGFI基因序列设计引物，对其启动子调控区域进行了克隆测序和预测。实验发现克隆测序得到的野猪3个不同个体启动子区域有很高的保守性，预测的启动子活性部位在271到521之间，符合大部分基因启动子活性位点，其中还包含了如CREB因子(体温调控因子)、转录因子Spl
本实验通过比较大白猪在不同妊娠时期子宫内膜的差异表达miRNA发现，miR-181c在妊娠15天和26天呈现下调表达，而这两个时期是胎儿丢失的两个高峰期，推测miR-181c的表达可能对调节子宫内膜环境发挥作用。通过软件预测发现雌激素受体α基因(ESR1)可能是miR-181c的靶基因，而ESR1与猪的产仔数显著关联，是一个重要的猪产仔数候选基因，因此本研究通过构建载体和检测荧光素酶活性，初步验证
为更好的了解MC4R基因的功能和调控机制，选取黑龙江省农科院畜牧研究所胚胎分子实验室保存7头纯野猪基因组样品，以NCBI数据库提交的家猪MC4R基因序列设计引物，对其启动子调控区域进行了克隆测序和预测，实验发现克隆测序得到的野猪7个不同个体启动子区域相似性很高，证明在野猪上编码MC4R基因的调控区域的序列保守性很高，基因调控专一性强，预测的启动子活性部位在-600bp左右，符合大部分基因启动子活性
本试验以FSHβ基因为目标基因，对82头米猪和111头白猪采集耳组织样本，酚/氯仿法提取DNA测含量，进行了比较分析，以初探米猪FSHβ基因型分布，为中国地方品种米猪的资源保护和利用提供基础资料。
本研究在实验室对WFIKKN2基因及序列进行分析基础上，研究在大白猪、通城猪不同组织、不同时期表达情况，探讨WFIKKN2在Myostatin信号通路中调节机理，进一步完善Myostatin调节骨骼肌发育机理，为猪肌肉发育相关基因的功能研究奠定基础。
本实验所用的主要材料为PRRSV高致病毒株GD株和经典毒株CH-la株，从广东某无PRRS发病史的健康猪场的长大杂交猪分离的PAM。PRRSV感染PAM后进行smallRNA高通量测序与分析，对筛选到的关键miRNAs进行功能验证。 应用Illumina高通量测序平台，测序获得了H-PRRSV与N-PRRSV病毒生命周期的多个时间点感染PAM的miRNA的表达特征。实验阐明了PRRSV感染诱导的P
本研究利用荧光定量技术检测不同时期猪卵巢组织中PTEN的表达量，探讨卵巢组织表达谱的差异及可能的分子生物学内在联系与规律，为进一步研究PTEN在卵巢的功能提供理论基础。
本实验选择马身猪和大白猪作为试验对象，两品种同一时间开始组建群体，采用相同的营养水平和饲喂方式，长到一定阶段后屠宰，提取总组织RNA并反转录为DNA。根据课题组克隆获得的马身猪ApoA5基因cDNA序列(HM991258设计特异性引物进行实时荧光定量PCR扩增，定量分析mRNA在两个品种猪的不同组织、不同发育阶段的表达变化规律。结果表明却oASmRNA表达量受到组织、品种和发育阶段的调控。