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马铃薯Y病毒(Potato Virus Y,PVY)是马铃薯种植产区重要的病害,CP蛋白是PVY唯一的结合蛋白,含有抗原决定簇,决定着病毒的抗原特异性.本研究克隆、表达和纯化了马铃薯Y病毒CP蛋白,并进行抗体鉴定,结果表明：序列分析PVY CP基因序列与22个参比序列相比均有不同程度的碱基缺失和突变,同一性为96.69％.应用DNAMAN6.0软件计算PVY各地区样品CP基因之间最低同源性为87.30％；最高同源性为99.90％.