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目的 应用分子遗传学方法探讨我国北方五省区(黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和宁夏)212株北京谱系结核分枝杆菌的起源进化及群体间基因流动特征.方法 对北京谱系结核分枝杆菌进行24位点可变数目串联重复序列(VNTR)基因分型，计算各VNTR位点的等位基因多态性(h)；从个体水平分析其系统发育，即构建N-J树和最小生成树；构建群体水平系统发育树，并在此基础上通过贝叶斯模型计算最近共祖年代；通过分子方差分析了解五省菌株间的基因流动情况.结果 24个VNTR位点的等位基因多态性较低(h值：0.000 ～ 0.805).212株北京谱系结核分枝杆菌分散存在于N-J树的各个进化分枝，最小生成树中约60.8％(129/212)的菌株被划分到同一"克隆复合群".群体水平系统发育树显示212株菌与MIRU-VNTRplus数据库(http：//www.miru-vntrplus.org)中的北京谱系结核分枝杆菌的遗传关系最近(Bootstrap值为100)；最近共祖年代为5052(95％CI：4000～6200)年.通过分子方差分析发现吉林与黑龙江、辽宁菌株之间，内蒙古与宁夏菌株之间遗传分化系数的差异无统计学意义(P＞0.05).结论 北方五省北京谱系结核分枝杆菌的遗传相似性较高.各省区菌株间种系发生关系不明显.推测这些菌株由近期(约5000年前)结核分枝杆菌北京谱系的某一"克隆"进化而来.地理位置接近的省份，菌株间存在基因流动现象.