【摘 要】
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水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.Oryzicola,Xoc)是导致水稻细菌性条斑病的病原菌,是热带、亚热带稻区的主要病原细菌之一,可以造成严重的水稻减产和经济损失.
【机 构】
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亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,广西大学生命科学与技术学院,南宁530005
【出 处】
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中国植物病理学会第十一届青年学术研讨会
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水稻细菌性条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.Oryzicola,Xoc)是导致水稻细菌性条斑病的病原菌,是热带、亚热带稻区的主要病原细菌之一,可以造成严重的水稻减产和经济损失.本研究对从广西贺州莲塘镇水稻条斑病发病植株上分离的一株病原分离株LT4进行了相关表型分析并筛选了一株具有利福平抗性的自发突变株GX0.该分离株基因组中含有一类属于avrBs3/pthA家族的三型效应物,是该病原菌中的重要致病因子.这些avrBs3/pthA家族成员高度保守,不同基因之间的氨基酸序列同源性达80％～97％,在单个基因的中间区域是几乎一样的0.5～33.5个重复的102个碱基的重复单元.通过Southern杂交实验推测,该菌株基因组中含有28个左右的avrBs 3/pthA家族效应物基因.为了更高效地开展功能基因组学研究,更深入、更系统地探究该病原菌的致病机理,本研究对GX01进行了全基因组测序.利用Solexa高通量测序和454测序技术,通过组装和初步补gap的工作,目前已获得了仅剩余13个gap的高质量基因组序列,总长度达到4.8M.鉴于avrBs3/pthA家族基因的特殊性,本研究构建了GX01菌株的高质量Fosmid文库,利用Southern杂交技术从中筛选含有avrBs3/pthA家族基因的候选克隆,并通过亚克隆测序,目前已获得了25个不同的avrBs3/pthA家族基因的精确序列.本研究目前已基本完成GX01菌株的全基因组组装与初步注释分析工作,将对更全面、系统地开展该病原菌的功能基因组学研究起到积极的促进作用.
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