绿竹BoEMF2基因的克隆和生物信息学分析

来源 :中国林学会竹子分会四届四次全委会暨第六届中国竹业学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:playallprogram
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从绿竹中克隆得到EMF2的同源基因,命名为BoEMF2,cDNA全长2500bp,CDS长1893bp,编码630个氨基酸残基。序列分析表明,BoEMF2包含VEFX-BOX家族典型的酸性氨基酸簇区域和锌指结构域,位点479K、480L、481S、483R、484A、485D、486P、490L、494Q、495L等,是重要的功能位点。进化分析表明,绿竹BoEMF2基因与竹类植物麻竹(Dendrocalamus latiflorus)、禾本科植物大麦(Hordeum vulgare)、小麦(Triticum aestivum)、玉米(Zea mays)、水稻(Oryza sativa)中的EMF2基因有较近的亲缘关系,其中与麻竹的一致性为97.3%,其次是大麦,小麦,而与茄科植物番茄(Solanumlycopersicum)的一致性达到53.53%,表明EMF2基因在植物中相当保守。
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