糖尿病是最常见的慢性病,其并发症危害大且难以治愈,它与癌症、心血管疾病被视为世界性三大疾病.中国约有1.1亿名糖尿病患者,约占中国成年人总数的1/10.中医历史上即有针对糖尿病的治疗方法,中医将糖尿病(在《黄帝内经》中称为"消渴病")分上、中、下消三种类型,分别用不同的中药方剂对糖尿病进行治疗.相对西药治疗的稳糖作用,中草药方治疗有些可以起到治愈的作用.中医药历史上有记载的能治疗糖尿病的中草药有近百种.随着现代医学对中草药治疗糖尿病的研究的逐渐深入，人们发现中草药在治疗糖尿病方面有独特优势，并进一步总结为几类作用途径，如灵芝孢子粉和葛根素等对提高人体胰岛素含量的作用，苦骨和三七皂苷作为胰岛素类似物起作用，大黄和黄连能增加胰岛素受体敏感性，五味子和苦瓜等通过降低胃肠道对葡萄搪等吸收起作用，玉竹和知母等通过保护胰岛B细胞不受损害间接改善胰岛的功能等。在探索中草药治疗糖尿病的可能性机制或者治疗效果的评价指标过程中，将中草药对糖尿病患者肠道菌群的影响纳入到研究体系中是必然趋势。通过第二代测序技术对肠道菌群进行量化研究的过程中将产生的大量数据，通过对数据的有序管理和计算分析，有利于对糖尿病患者的个体化差异进行聚类以及模型化处理，实现对中药药效评价的量化研究，甚至通过肠道菌群的分型达到对患者分型的效果，最大化实现中药的治疗药效。同时，结合第二代测序技术在中药成份鉴定方面的技术应用，可以极大程度的将中药复杂性以稳定的量化数据形式进行评估，从而通过大数据与药效建立关联关系，形成稳定的中草药药效的生物评价系统。