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医学信息学是伴随着信息技术在医学领域的应用而产生的一门交叉性学科，对于医学数据的挖掘、分析、利用等具有天然的优势，但是在大数据环境之下，传统的数据处理在深度挖掘与分析方面显得略显不足，这种不足也为医学信息学自身的发展提出了新的挑战。文章介绍了大数据时代，阐述了生物医学大数据与医学信息学，并就大数据环境下医学信息学教育的变革探讨了实现大数据价值将成为医学信息学教育的新目标、生物医学数据的挖掘和分析技术将成为医学信息学教育的新内容、医学伦理与数据使用规范将成为医学信息学教育的新准则、数据标准化将成为医学信息学教育的新挑战。为促进大数据环境下医学信息学教育的发展，建议树立良好的医学信息学资源观念，同时建立健全的医学信息学教学模式，开展合适的医学信息学教育决策，制定合理的医学信息学培养方案。