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Young课题组(2013年)在人和鼠胚胎干细胞(ESCs)中鉴定了一群具有高度转录活性的增强子功能域,将其命名为超级增强子(Super-enhancers,Ses)(PMID：23582322,23582323,24119843).与常规增强子相比,Ses 的长度可为数十kb 到一千多kb(常规增强子通常长数百bp),表达更高水平的调控因子和转录因子,有更高的转录效率,有更高的激活SE 相关基因(SE-associated)转录的能力,对外界干预(如药物)也有更高的敏感性.Ses 和SE 相关基因表达谱具有细胞类型特异性,只需数十个到数百个Ses 即足以调节赋予每种细胞特性和功能的大多数关键基因,而调节基因表达的常规增强子数量高达40 万个到140 万个.Ses和SE 相关基因也具有明显的血细胞系列特异性,在T 淋巴细胞、B 淋巴细胞和髓细胞的正常生长和发育以及向白血病细胞转化中发挥了重要的作用.Chen Z 课题组(2004 年)应用EST 技术分析了斑马鱼成鱼定向造血(definitive hematopoiesis)器官--肾脏的造血基因表达谱,共测序了26143 个EST 序列,对应7742 个转录子(PMID：15520368).应用ChIP-seq和生物信息学技术,我们首次在国内、外建立了斑马鱼成鱼肾脏中造血超级增强子及其相关基因的表达谱.在成鱼肾脏中,共鉴定了74 个Ses、平均大小为8741 bp(1902 bp-44521 bp)和2189 个常规增强子、平均大小为1381 bp(337 bp-15848 bp).在作为对照组的成鱼肝脏中,共鉴定了70 个Ses、平均大小为9654 bp(1998 bp-37615 bp)和1983 个常规增强子、平均大小为1656 bp(457 bp-21423 bp).比较成鱼肾脏和肝脏的Ses 后发现,两组Ses 中只有4 个Ses(对应3 个SE 相关基因)是相同的,提示Ses 在成鱼肾脏和肝脏中有很强的组织类型特异性.功能上,SE 相关基因可以分为以下类型：与核酸、序列特异性DNA、RNA聚合酶Ⅱ 核心启动子近端区域序列特异性DNA 等相结合的因子,与转录因子、酶、多种受体等蛋白相结合的因子,与金属离子结合、调节离子通道活性的因子,与ATP、GTP、乙酰化组织胺等相结合的因子等,这些因子参与信号转导,从而发挥相应的生物学功能.以上结果将为深入探讨造血超级增强子及其相关基因在调节斑马鱼造血的机制研究奠定理论基础.