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县域生态补偿机制最大的障碍就是如何正确评价其服务价值。主要使用市场价值法、影子工程法、旅行费用法对县域生态系统服务进行较为全面的价值评估。通过调节服务价值、供给服务价值、支持服务价值以及文化服务价值体系以北京市昌平区的生态系统为例做出评估;得出昌平区的生态系统的总服务价值为251.44亿元,其中调节服务的价值为227.67亿元、供给服务价值为11.38亿元、文化服务价值以及支持服务的价值为11.34亿元,该结果对该地区生态补偿、功能区划分、规划及其它县域生态系统服务价值的评估和其体系的构建提供参考。