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为了检验更新世冰期和环境因子对海洋鱼类进化的影响，采用线粒体DNA对玉筋鱼的系统地理分布模式和遗传结构进行了研究。在玉筋鱼群体内检测到两个显著分化的单倍型类群，更新世冰期的隔离可能是这两个类型产生分化的原因。为了进一步解决玉筋鱼南北两个组群的分类地位和研究环境因子对玉筋鱼核基因的影响，利用Ammodytes hexapterus作为外群，对玉筋鱼12个群体共211个个体进行了AFLP分析。结果表明玉筋鱼南北两个组群是互为单系的关系，并且两组群间有完全的基因隔离，玉筋鱼南北两个组群可能是不同的亚种或种。两个组群的分化可能是玉筋鱼从北太平洋向南扩散适应不同温度的结果。