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生物的寿命受遗传和环境的影响,利用模式生物对衰老相关基因的研究已取得一定成果,这些研究已经初步阐明寿命受某些特定基因的调控.人载脂蛋白E (apolipoprotein E,APOE)基因与人类寿命密切相关.载脂蛋白E是34ku大小的多功能分子,在脂类代谢中发挥重要作用.本研究根据功能基因组学和生物信息学,研究了猪APOE基因的表达调控,主要的研究结果如下：1.获得长度为1693bp的猪APOE基因5’调控区序列.生物信息学分析5,调控区发现存在许多重要的调控元件.2.采用不同品种PCR混合样测序方法进行SNP筛查,发现5调控区存在3个突变位点,分别是：-419G/A、-134 T/A及+523A/T.进一步对3个位点所在基因组DNA区域的转录因子结合位点预测分析发现,-134位点是核转录因子Pur-alpha、MAZF、EGRF、EKLF与APOE顺式作用元件结合的核心位点.当T＞A突变时,由GA box突变成CACCC box.3.通过对-134T/A位点的SNP筛查发现,T等位基因频率在中外猪种(大花白、蓝塘、长白和大白)的分布都表现为T等位基因占优势.4.采用实时荧光定量PCR对APOE-134T/A多态位点不同基因型的mRNA表达量分析发现：①APOE在TT型长白和大花白猪的肝组织平均表达量分别为0.628±0.09和0.613±0.06,差异不显著；②APOE在不同基因型的大花白猪的肝组织的平均表达量最高为AA型6.85+0.41,其次为TA型3.63±0.52,最低为TT型0.628±0.09,基因型间的表达量差异极显著.-134位点等位基因A显著促进APOE基因的表达水平.5.SNP-134多态位点不同基因型的启动子活性检测表明,A型的活性比T型高6.8倍.这些结果表明：SNP-134位点前后一段序列是极为关键的上游调控元件,该SNP位点是具有重要功能的多态位点.-134位点突变前后都为顺式作用元件的核心碱基.当T突变为A时,反式作用因子与顺式作用元件的亲和力提高,同时所结合的反式作用因子也有一定的改变.当SNP-134A顺式作用元件被激活时,猪APOE的表达显著上调.因此该突变是功能性的突变.