普通油茶成花过程转录组和数字表达谱测序及影响成花相关基因表达分析

来源 :2015全国植物生物学大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:flyinghdl1
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  普通油茶(Camellia oleifera Abel)是我国油茶种植的主要品种,而普通油茶雌雄同花,自交可育性低,因此出现油茶多花低产的现象,由于油茶天然雄性不育系非常少,因此通过基因操作的方式创制人工雄性不育系,可以有效提高油茶异花授粉率,因此研究普通油茶成花机制,明确油茶成花转变的关键基因及影响油茶雄蕊发育的关键基因对油茶的高效育种和高产栽培具有重要意义.通过对普通油茶成花过程的转录组和数字表达谱测序及生物信息学分析,分析成花相关基因在不同发育阶段,不同器官及不同生长条件下特异性表达,以明确成花关键基因及普通油茶成花模式.结果表明:普通油茶基因组GC 含量为46.52%,并获得5.74Gb 的数据量,CycleQ20 达到100%;De novo 组装后共获得94,476 条Unigenes,油茶和葡萄的Unigenes 同源性较高,其中长度在1kb 以上Unigenes有12,643 条,共获得41,240 条Unigenes 的注释结果;6 个时期样品测序共获得原始reads 数103,249,386 条,平均CycleQ20 均达到100%各样品测序reads 与转录组部分测序构建Unigene 库的序列比对,比对效率均在60%以上;进行样品间的差异表达基因分析,共获得差异表达基因26,86 个;FLC 基因在油茶根部和实生苗茎尖表达量最高,FAC 在短日照和强光处理下表达量最明显,在花芽分化期比器官形成期表达量高,FT 基因主要在叶片中表达,在成花过程中茎尖都有一定水平的表达,AP1 在春梢萌芽期表达量较高,AP2 在花芽分化期,雄蕊形成期及雌雄蕊成熟期表达量明显较其他时期高,PI 基因在芽分化期和雄蕊形成期表达量较高.初步认为油茶成花过程是基于一定高温诱导的遗传自主途径,其中FT基因(unigen ID:60063)是影响油茶成花转变的关键基因,PI 基因(unigen ID:56059)是影响油茶雄蕊发育的关键基因.
其他文献
会议
Drought stress is one of abiotic stresses limiting plant growth and agricultural productivity.To further understand the mechanism of drought tolerance and to id
会议
会议
会议
  谷子(Setaria italica)属于狗尾草属C4 植物,在中国有悠久的栽培历史,是我国北方地区重要的杂粮作物。由于其基因组小,且全基因组序列已测定,近年国际植物科学研究领域已
会议
会议
  人血清白蛋白是人血液中的主要蛋白成分,占人血液总蛋白的30%,完全从血浆中提取,在临床上用于失血、创伤及烧伤等引起的休克、脑水肿、肝硬化、肾病综合症、腹水、严重烧
  Identifications of mutations in target genes are essential for functional analyses of genes.TILLING(Targeting Induced Local Lesions in Genomes),a powerful r
The ascomycete fungus Fusarium graminearum is a well-known pathogen of wheat,barley and maize,and it is responsible for devastating diseases Fusarium head bligh
会议
  The gamyb5,a no pollen male sterile mutant was identified from the mutant library of 60Co-γ-treated indica cultivar Zhonghui8015(Zh8015).There were not sig
会议