基于空间特异性标记技术的核糖核蛋白颗粒动态结构与亚细胞定位研究

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真核细胞的mRNA与各类RNA结合蛋白,非编码RNA及各种代谢产物相互作用共同组装成信使核糖核蛋白颗粒(mRNP)。mRNP是真核基因表达调控的核心元件,其动态结构变化与亚细胞定位对于mRNA生命周期的各个功能阶段的调控具有重要意义。目前用于研究mRNP组分与功能的方法主要依赖于紫外交联和免疫沉淀,不能实现针对某一特定细胞结构或亚细胞区域中mRNP的空间特异性标记。我们致力于发展一种新的RNA标记与检测技术。该方法的原理是利用可遗传编码的光敏分子在细胞中原位产生活性氧自由基,短时间内对分子附近的RNA进行标记,随后从细胞中提取核酸并利用高通量测序技术检测标记位点。我们将这一技术称为Chromophore-assistedproximitytagging,简称CAP-tag。该技术可用于研究活细胞中特定亚细胞定位的mRNPs的生化组分与动态变化。目前我们已对标记产物进行了初步表征并建立了RNA标记产物的体外检测方法。未来将利用CAP-tag探索应激颗粒、处理小体、神经突触等细胞区域中的RNA组分,并深入研究它们的生物学功能。
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