随着教育市场化进程的日益推进，民办高校作为高等教育的重要组成部分，迅速崛起，这对优化教育结构、扩充教育资源、推动教育改革都起到了至关重要的作用。民办院校治理结构一方面受公办院校的深刻影响和束缚，一方面借鉴着国外私立院校治理经验，不断适应国内的教育市场和环境。本文借鉴公司治理转型的动态分析视角，立足中国政府职能转变与教育体制改革的时代背景，在对大学治理相关研究成果进行回溯的基础上，借鉴公司治理转型的分析框架，通过对民办高校内部的权力属性进行分析与界定，将政府规制权、民资经济权、内部行政权与学术权进行了系统构建与界定，并构建一个立足"教育资源投入一治理机制转换—教育产出"的行为分析框架下的民办高校治理机制模型，分析民办高校治理机制的动态演进过程，力图打开民办高校治理机制的"黑箱"，将大学治理的制度合法性与行为有效性动态的结合起来，最终形成民办高校治理机制演进的发展路径和实施策略。本研究不仅对于探索中的民办高校治理具有一定的理论指导意义，对于市场导向下的公办高校治理结构优化也同样具有较强的参考性。