蛋白质组学研究的迅速发展与其一系列研究的成功，使医学研究真正进入到了分子水平。通过高通量的技术检测，现在不仅可以在一个多蛋白质的混合体系中(如人体的血液，分泌液，组织液等)对不同类型的蛋白质加以区分，还能准确地测出它的分子量。即便是差1个氨基酸，也能准确地测出来。蛋白指纹图谱技术，在吸收传统质谱技术优点的基础上，克服了传统技术中某些缺点，创造性的增加了特异蛋白芯片阅读系统，可称作蛋白质检测技术最新一代或第四代产品。蛋白指纹图谱技术的基本工作原理是利用激光脉冲幅射使芯池中的待测分析物解吸形成电荷，根据不同质荷比这些解吸的离子在仪器测试场中飞行时间长短不一，分子量大的时间长，分子量小的时间较短，由此绘制出被测物质的质谱图，该图经计算机特殊软件处理还可绘制成模拟图谱，同时显示各种蛋白质的分子量，含量等多种信息。将一个人蛋白质的测定图谱与正常人或某种疾病(如老年性痴呆，肿瘤等)的图谱或基因库中的图谱相对照，就能知道这个人的图谱是正常或是患有某种疾病，或是存有某种尚未明了的新的特异蛋白生物标志物，整个测定一般几十分钟就全部完成。