先导化合物的发现是药物发现过程中至关重要的步骤,而先导化合物的获取一直是一个需要耗费大量人力物力的过程。随着计算机技术的发展,计算化学方法已经广泛应用到先导化合物发现的过程来。分子对接是一种常用的计算化学方法,能够用于研究受体与配体的相互作用,并进一步地指导新化合物的设计。分子对接方法有两个基本目的,即预测分子与靶标的结合模式并预测他们与受体的结合能力。当前,已经有很多很多分子对接方法可以应用于蛋白-小分子的对接。在当前的工作中,我们希望通过多种对接软件的组合来提高分子对接方法的准确性。我们利用六种免费分子对接软件(AutoDock,Vina,PLANTS,iGEMDOCK,LEDOCK和DOCK)和两个单独的打分软件(Xscore和NNscore)得到的分子构象和给出的打分发展了一个"一致性"的方法。通过对包含195个复合物的体系进行研究我们发现,我们的一致性方法的准确率相对于单个对接软件提高了15%,平均RMSD值减少了0.9A。另一方面,我们的方法预测的结合能与实验值的相关系数达到了0.47。