【摘 要】
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采用简化基因组方法对光倒刺鲃进行测序分析,结果表明在简化基因组测序中得到的34776 条unigenes 中共检测出30574 个EST-SSR 位点,EST-SSR 位点长度分布从12-333bp 不等.在光倒刺鲃简化基因组测序中得到的重复基元以二、三、四核苷酸重复单元为主导类型,分别占总SSR 的52.71％、12.73％、28.66％.随机选取20 对引物进行PCR 扩增,其中能够稳定扩增出
【机 构】
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广州大学生命科学学院,广州510006 韶关市水产研究所,韶关512006
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采用简化基因组方法对光倒刺鲃进行测序分析,结果表明在简化基因组测序中得到的34776 条unigenes 中共检测出30574 个EST-SSR 位点,EST-SSR 位点长度分布从12-333bp 不等.在光倒刺鲃简化基因组测序中得到的重复基元以二、三、四核苷酸重复单元为主导类型,分别占总SSR 的52.71％、12.73％、28.66％.随机选取20 对引物进行PCR 扩增,其中能够稳定扩增出条带的共12 对.通过毛细管电泳得到,等位基因数(Na)为7 到11 个,平均等位基因数为9.5 个；观测杂合度(Ho)的大小在0.38 到0.79 之间,平均为0.65；期望杂合度(He)在0.78 到0.89 之间,平均为0.83；多态信息含量(PIC)的大小在0.74 到0.86 之间,平均为0.80.
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