麻竹miR172及其靶基因DlAP2的克隆与表达分析

来源 :第十一届中国林业青年学术年会第8分会场 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hether_yan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  APETALA2(AP2)亚家族转录因子主要参与植物的生长发育过程,如调控花、分生组织、胚珠和种子发育等.AP2基因属于花发育模型中的A类基因,参与花瓣发育调控,同时其自身表达又受到miR172的调控,miR172是通过对AP2基因的切割作用来调控的.竹子开花的调控一直倍受关注,借助分子生物学手段从分子水平揭示其调控机制己成为研究热点.为揭示miR172和AP2基因在竹类植物中的表达调控情况,以开花麻竹(Dendrocalamus latiflorus)为试材,开展了研究.采用RT-PCR和RACE技术克隆得到AP2同源序列cDNA全长,命名为DlAP2.序列分析表:DlAP2基因cDNA全长1729 bp,包含5’端非编码区81 bp、开放阅读框1464 bp、3’端非编码区160 bp及24个碱基的PolyA尾巴,在编码框靠近3’端130 bp处有一个高度匹配miR172结合位点(CTGCAGCATCATCAGGATTCT).DlAP2编码一个487 aa的蛋白,预测的蛋白分子量为52.75 kDa,理论等电点为6.859.该蛋白与来自其它单子叶植物的AP2蛋白均有着较高同源性,其中与毛竹的AP2 (AGH68972) -致性最高(84.6%),与模式植物水稻的转录因子AP2D23-Iike (AAW78371)、拟南芥ARGET OF EARLY ACTIVATION TAGGEDI(T NP_001189625)的一致性分别为75.1%和49.6%.该蛋白具有两个AP2结构域,属于AP2/ERF家族AP2亚家族的AP2组.基于miRNA成熟序列的保守性,根据毛竹(Phyllostacys edulis)含有miR172颈环结构的基因组序列设计特异性引物,以麻竹基因组DNA为模板,进行PCR扩增.经过测序获得了80 nt的核苷酸序列,采用RNA Structure 4.6软件分析结果显示,具有典型的发夹二级结构,且成熟序列完全位于5’端,获得了该颈环结构对应的前体核苷酸序列,即麻竹miR172的前体序列.采用茎环引物法设计茎环引物和通用引物对miR172的表达进行定量分析,结果表明在1.0 cm花芽、1.5 cm花芽、2.0 cm花芽、开花幼枝、开花枝条顶端叶片、开花植株未开花枝条顶端叶片和未开花植株叶片中miR172的表达量呈现逐渐下降的趋势,其中在1.0 cm花芽中的表达丰度最高,未开花植株叶片中的表达丰度最低,而开花枝条顶端叶片和开花植株未开花枝条顶端叶片中的表达丰度相接近.采用实时定量PCR对DlAP2基因的表达分析结果表明:与miR172的表达相应,DlAP2基因在不同组织中的表达呈现恰好相反的趋势,在1.0 cm花芽中的表达丰度最低,未开花植株叶片中的表达丰度最高,表明miR172对DlAP2基因的表达具有调控作用.
其他文献
在研究生培养体系中,学术型研究生与专业学位研究生培养模式并存是适应社会发展对人才多元化需求的必然趋势,由于专业学位研究生的发展时间较短,存在与学术型研究生“混养”
人们常食用辣椒的果实,而把椒叶扔掉。其实,椒叶也含有丰富的钙质、胡萝卜素、维生素和其他营养元素。医学家认为常食辣椒叶能起到驱寒温胃、补肝明目、减肥美容等作用。鲜嫩的
本文在对本校研究生党支部建设情况调研的基础上,分析了研究生党支部建设中存在的问题,从设置模式、教育方式、管理模式、考评激励机制等方面,进一步优化研究生党支部作用发
  林木种质资源具有基因丰富,遗传多样性复杂的特点,但是许多天然优良基因尚未被分离利用,大部分基因的功能仍处于未知状态,特别是近年来,随着全球气候的日益变迁,造成天然林木种
会议
本文通过研究分析博尔特在百米途中跑过程中技术动作,结合“屈蹬式”技术特点进一步阐述“屈蹬式”技术优势,探讨其对百米跑运动成绩的影响.对我们研究短距离跑的运动技术,提
李振宁,中国最早了解国际股市并参与股票买卖的经济学家之一。2001年后致力于解决股权分置问题,作为证监会解决该问题的三人小组成员之一起草了方案第一稿。人物周刊:2月27日
伴随全球温室效应的持续加剧、节能减排压力日益增大,森林固碳作为CO2减排的一种重要途径,森林碳汇功能与碳循环成为国际研究的热点.随着《京都议定书>生效实施,人工林的栽培
会议
本文综述了河南农业大学注重研究生廉洁教育,坚持实施研究生廉洁教育"123"模式,总结了其工作经验与启示,一是制度建设是关键。廉洁教育是一项复杂的系统工程,要积极探索和把握
会议
06年国家电网公司实际完成电网投资约1584亿元,同比增长42.6%。预计07年两家电网公司总计投资规模为2438亿元,同比增长为24.6%。在未来电网投资中,高电压等级产品、新技术产
应用系统工程的方法解决安全生产问题是一个比较新的课题。本文就其内容、方法和应用问题提出试探性意见。 一、安全系统工程及系统安全 为生产某种产品或达到某种目的,把人