【摘 要】
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利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、大白猪和梅山猪共60个样本的胰岛素样生长因子2基因5调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究.结果找到10个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T和C6164T.所有位点均为二等位基因型,T6029A为T←→A碱基颠换,A5976G为A←→G
【机 构】
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西南民族大学生命科学与技术学院,成都,610041 海南省农业科学院畜牧兽医研究所,海口,5711
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利用PCR产物直接测序法,对五指山猪、滇南小耳猪、香猪、大白猪和梅山猪共60个样本的胰岛素样生长因子2基因5调控区部分片段的单核苷酸多态性进行了研究.结果找到10个SNP,分别是:C5872T、C5888T、A5976G、C6010T、T6029A、C6037T、C6043T、C6063T、C6112T和C6164T.所有位点均为二等位基因型,T6029A为T←→A碱基颠换,A5976G为A←→G转换,其他均为C←→T转换.统计各位点等位基因和等位基因型在总群体与各品种内的分布频率,发现在A5976G位点,五指山猪、滇南小耳猪和香猪的优势等位基因均是G,而大白猪和梅山猪该位点优势等位基因均为A;在C6164T位点,三个小型猪的优势等位基因均为T,而另两个猪品种该位点优势等位基因都是C;A5976G处于IGF2基因外显子1区域,可能直接或通过改变启动子1的组成而引起IGF2结构和功能发生变化.并针对这10个SNP位点进行组合基因型分析,找到21种组合基因型,发现Hap 18型(TCGCTTCTIT型)仅出现于三种小型猪中,而Hap 14型(TCACTCCTTC型)仅出现于大白猪和梅山猪中.结果反映,A5976G与C6164T SNP位点和Hap 18型与Hap 14型组合基因型可能与小型猪的矮小机制有关.
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