为探明广西甘蔗主产区甘蔗根围深色有隔内生真菌(DSE)的种群分布情况,以茄子为诱饵植物诱捕土样中的DSE真菌,并对其根部进行表面消毒、分离纯化共获得1302株内生真菌,通过致病性测定和根部镜检筛选获得DSE真菌42株,分离率为3.23%。其中36株DSE真菌通过菌株形态学分析,以及ITS1-LR5 r DNA序列分析,鉴定为10属15种,能够确定至种名的有2属3种,其中分离到的Cladophialophora属有13株,相对分离率为31%,为优势种群;其他分离率较高的为:Conlarium属有4株、Pleosporales属有3株、Chloridium属有3株,相对分离率分别为9.5%、7.1%、7.1%。发现广西甘蔗主产区蔗地土壤DSE真菌的数量、种属组成与分布情况存在较大的差异,其中,南宁地区分离到6属9种,优势属为Conlarium;百色地区分离到3属3种,优势属为Podospora;河池地区分离到2属4种,优势属为Cladophialophora;柳州地区分离到8属8种,优势属为Cladophialophora;崇左地区分离到3属3种。不同地区的土样存在自己特有的种群,说明广西甘蔗根围DSE真菌存在较为丰富的物种多样性,为今后DSE真菌资源开发利用奠定了良好的基础。