Applications of Next Generation Sequencing in Plant Virology

来源 :中国植物病理学会2016年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tigerbi
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  Nextgeneration sequencing (NGS) technologies provide a high throughput,efficient andfast DNAsequencing platform compared to the standard and traditional technologies.
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香蕉是热带和亚热带地区重要的经济作物,在世界水果贸易和消费中占有极其重要的位置,中国是世界第三大香蕉生产国。而香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)引致的香蕉束顶病毒病是世界香蕉产业生产中的主要限制因子之一,目前还没有切实有效的防控方法,其中种植无病种苗是当前防控该病的主要措施之一,而无病种苗的生产有耐于快速、高效和简便的检测方法。
番茄斑萎病毒属病毒是一类对农业生产造成严重危害的植物多分体负义链RNA病毒,而Sw-5b是番茄上进化出的一个针对番茄斑萎病毒属病毒具有广谱抗性的免疫受体蛋白。近年来的研究表明免疫受体蛋白的亚细胞定位在抗病信号通路中发挥着重要作用,番茄Sw-5b是一个含有额外的N端结构域(NTD)的CC-NB-LRR类型的免疫受体蛋白,该蛋白的亚细胞定位以及在抗病中的作用还并不清楚。
This study is aimed to isolate and screen bacteria strains from tobacco rhizospheric soil,which have antagonistic activities against soil-borne pathogenic fungus of tobacco.
溃疡病是柑橘上的一种检疫性病害,对柑橘生产造成严重影响。该病对柑橘品种的选择性很强,以甜橙类受害最为严重。前期试验中发现柑橘抗病品种中的可培养内生细菌相对于感病品种来说种类少、数量多、强颉颃菌株比重大。
密执安棒状杆菌(Clavibacter michiganensis)为放线菌目、微球菌科、密执安棒状杆菌属,是重要的植物病原细菌.其中,密执安棒状杆菌的5个亚种:Clavibacter michiganensissubsp.nebraskensis(缩写CMN)、Clavibacter michiganensis subsp.michiganensis(缩写CMM)、Clavibacter mic
Transcriptional regulators play crucial roles in modulation of virulence factor production in pathogens.
细菌性疮痂病(bacterial spot)是番茄和辣椒等茄科作物上的常见病害,4个种的黄单脆菌(Xanthomonas euvesicatoria、X.vesicatoria、X.perforans和X.gardneri)均可引起该病害.疮痂病菌在世界大多数国家和地区均有报道,被欧洲及地中海植物保护组织(EPPO)列为A2类检疫性有害生物.
黄单胞菌属细菌(以下简称黄单胞菌)是重要的植物病原细菌,可以侵染400多种植物,在农业生产中造成严重危害。黄单胞菌合成一种附膜的黄色色素,又称为菌黄素。菌黄素能保护细菌抵抗光伤害,并提高细菌在寄主体表的附生能力。
万寿菊的杀线活性广受关注,本研究对万寿菊秸秆的综合利用进行了初步尝试。通过生物测定和温室试验,研究了万寿菊秸秆、添加万寿菊秸秆的平菇栽培基质及菊叶对根结线虫的抑杀作用,明确了万寿菊秸秆对根结线虫的防治效果。
Bacterial fruit blotch (BFB) is a devastating disease of cucurbits and has caused signifi-cant economic losses of cucurbits industry worldwide.