【摘 要】
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目的:研究PRPS1突变在儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)复发中的分布频率及其参与儿童ALL复发的分子机制.\方法:通过对儿童ALL初发、缓解和复发样本的DNA抽提、基因组DNA打断、全外显子组捕获、建库、测序和生物信息学分析等方法,获得复发特异性基因突变类型和大致频率;通过对样本中重复出现的复发特异性基因突变进行人工校读、测序验证、蛋白结构预测和大样本验证,获得相关复发特异性基因突变在儿童ALL
【机 构】
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上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心血液肿瘤科 200127
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目的:研究PRPS1突变在儿童急性淋巴细胞白血病(ALL)复发中的分布频率及其参与儿童ALL复发的分子机制.\
方法:通过对儿童ALL初发、缓解和复发样本的DNA抽提、基因组DNA打断、全外显子组捕获、建库、测序和生物信息学分析等方法,获得复发特异性基因突变类型和大致频率;通过对样本中重复出现的复发特异性基因突变进行人工校读、测序验证、蛋白结构预测和大样本验证,获得相关复发特异性基因突变在儿童ALL中的分布频率;通过制备野生型和各种突变体慢病毒转染人白血病-REH、Jurkat、Molt-4、Nalm-6等细胞株,经常见化疗药物的耐药实验研究,确定其可能参与儿童ALL复发的可能机制;通过对野生型蛋白和突变蛋白的功能研究,确定其参与儿童白血病复发的可能分子机制.
结果:通过对16对儿童ALL初发、缓解和复发样本的全外显子组测序,发现了419种复发特异性非同义突变(涉及409个基因),其中初发特异性突变17种(涉及17个基因),初发和复发共存的突变93个(涉及92个基因),复发特异性基因309个(涉及305个基因),另外,还发现了102种同义突变,分别位于基因编码区(30种)、5和3 UTR区以及基因剪切位点区(21种)。
结论:PRPS1突变会导致其蛋白的高活性,后者加速细胞内嘌呤从头合成途径,拮抗外源药物细胞毒作用的发挥,从而导致外源药物选择性的杀死相对敏感的自体细胞,对肿瘤细胞起到了保护作用。另外,通过对PRPSl复发特异性位点的动态监测有助于早期监测复发克隆的产生,从而有助于复发患儿的早期干预。
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