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房山为三水合围的区域,东面为永定河,北面为大石河,南面为拒马河。房山是以岩溶景观为特色的世界地质公园,北面的大石河流域自上而下,依次发育鸡毛洞、银狐洞、石花洞和孔水洞,由一条地下暗河将其连为一个洞系。南面的拒马河流域,为平缓的中元古代雾迷山组硅质条带白云岩山地。白云岩的化学成分为CaCO3和MgCO3,在水和可溶性CO2的作用下,山体上部的岩石被溶解,导致房山地貌(新近纪石林与第四纪岩溶陡壁的组合形态)的形成。在动物界,有硬肢马陆属和大足鼠耳蝙蝠为房山独有。在植物界,有5种以百花山命名的特殊植物种属。按照北京“两轴、两带、多中心”的空间发展布局,房山属于北京“西部生态带”的范围。建设好房山世界地质公园将对落实科学发展观、建设和谐社会、带动首都西南区域经济发展起到积极的推动作用。