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目前，我国各级环境监测部门均为事业单位(地市级以上基本为全额拨款的环境监测站，其他三级站也有部分为自负盈亏的环境监测站)，在经济上完全依赖各级政府，经费由国家各级财政统一划拨。长期以来环境监测系统只重视社会效益而忽视经济效益，造成监测部门运行成本偏高，导致政府财政负担加重。但在市场经济条件下，特别是当前全国各党政机关都在压缩行政开支，全力“保增长、保民生、保稳定”的时期，环境监测站进行成本核算就显的尤为必要。