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豆科植物因其重要的经济、生态学和生物学价值而一直被作为研究的重点,但是由于自身较大的基因组结构和复杂的复制机制等因素,其研究进展一度相当缓慢.然而随着比较基因组学的发展和豆科模式植物的建立,人们通过与其模式植物间的宏观及微观同线形的研究从而使其发展不断产生新的突破.本文主要从豆科基因组的特点入手(包括豆科基因组的复制,不同豆科植物间基因组所存在的大小差异),解释豆科比较基因组学研究的必需性和可行性,进而向读者详细介绍了豆科植物比较基因组研究中的宏同线性和微同线性现象并着重从横向和纵向两个方面分别介绍了两者各自的研究发展史、所取得的进展和启示等,并肯定了模式物种拟南芥、蒺藜苜蓿和百脉根在研究中所发挥的积极作用,最后介绍了豆科比较基因组学研究的应用及其展望。