对3株同一地区相隔5到10年的H9N2亚型禽流感病毒血凝素(HA)基因进行扩增、测序，通过序列及关键位点分析，研究H9N2亚型流感病毒变异情况。分析测序结果表明：所扩增的HA基因全长1683 bp，编码560个氨基酸;3个毒株的裂解位点的氨基酸序列均为R-S-S-R，属于低致病力毒株;分离株氨基酸推倒序列分析发现均存在7个相同的潜在糖基化位点，受体结合位点为禽源性流感病毒特异性序列，左侧壁氨基酸均为NGQQG，右侧壁均为GTSKA。与一些参考毒株的HA基因序列进行比较分析表明分离株与参考株核苷酸与氨基酸同源率均较高，仅有一些非关键位点突变，进化树分析表明3个毒株均属欧亚种系，与A/duck/Hong Kong/Y280/97代表株亲源关系较近.从分子水平证明了H9N2亚型禽流感病毒未发生较大变异，98年的疫苗毒株制备的疫苗能够对当前流行的毒株提供抵抗力。